Le projet COKETES représente une innovation stratégique pour Madagascar, en introduisant une approche opérationnelle centrée sur les espèces, fondée sur la science et étroitement liée aux réalités socio-économiques locales. Il renforce la cohérence entre conservation de la biodiversité, développement local et engagements internationaux du pays, notamment dans le cadre de la Convention sur la diversité biologique.
En favorisant la participation des communautés locales, le partenariat entre institutions publiques, ONG, institutions scientifiques et secteur privé, et la mobilisation de cofinancements significatifs, le projet pose les bases d’une conservation durable, reproductible et évolutive des espèces endémiques malgaches.